LAMMPS on Tesla GPUs

LAMMPS on Tesla GPUs

 
 

LAMMPS是一款經典的分子動力學套件,專門針對能夠在平行系統上順暢地執行而量身設計。CUDA版本的LAMMPS是透過將力計算(force calculations)移轉到繪圖處理器上來進行加速。

下載與安裝

  • GPU LAMMPS
    • GPU LAMMPS碼可支援MPI,並可發展為一個大型的GPU叢集。

測試數據

您可以從以下測試結果看出,利用繪圖處理器執行LAMMPS將呈現出顯著的效能提升。利用兩顆Tesla繪圖處理器執行 GPU-LAMMPS的效能表現甚至比用24個CPU來執行程式的結果還要優異。

LAMMPS Results on CPU vs GPU Clusters
以上數據由Oak Ridge國家實驗室Scott Hampton 與 Pratul K. Agarwal提供

技術文章與簡報

論壇

GPU 解決方案

使用者可在搭載繪圖處理器的桌上型個人超級電腦或資料中心中,進行Tesla Bio Workbench應用程式配置。 這些建構於革命性大量平行CUDA架構上的解決方案是針對加速運算科學的研究結果而量身設計而成。

建議硬體配置

桌上型工作站配置資料中心配置
  • 繪圖處理器
    • 4顆Tesla C1060繪圖處理器
  • 中央處理器與主記憶體
    • 2.33+ GHz x86 中央處理器
    • >16 GB (每一顆Tesla C1060繪圖處理器擁有4 GB的主記憶體)
  • 每個節點的繪圖處理器
    • Tesla S1070 (一台1U系統中有4顆繪圖處理器)或搭載M1060繪圖處理器的混合式伺服器
  • 中央處理器與主記憶體
    • 每一台伺服器擁有一個2.33 GHz x86中央處理器
    • 每一台伺服器擁有16 GB的主記憶體

Tesla Personal Supercomputer Tesla GPU Computing Clusters
工作站解決方案
TESLA個人超級電腦 

節省空間,可放置於桌上的個人超級電腦
 
資料中心解決方案
TESLA GPU運算叢集 

專為大型設備運算而設計