AMBER on Tesla GPUs

AMBER軟體中的Generalized Born與 PMEMD 模擬功能是利用CUDA技術的繪圖處理器進行加速而完成的。透過搭配以CUDA架構所建構的Tesla GPU運算解決方案，可提供高達7倍至8倍的效能加速。

下載與安裝

• 下載AMBER CUDA字母碼
• 支援Generalized Born
• 即將針對PME提供支援
• 下載頁面中也將提供安裝指南

測試數據

以下為利用兩台不同系統執行Generalized Born模擬的測試數據比較

	以上數據由聖地牙哥超級運算中心提供

技術文章與簡報

• 2009年超級電腦大會(SC09): NVIDIA針對AMBER提供之支援總覽-獲取的經驗與得到的能力 – 由 聖地牙哥超級運算中心Ross Walker於2009年繪圖處理器技術大會所發表。
• 2009年繪圖處理器技術大會: 利用繪圖處理器運算計算生物物理與遠距靜電 – 由NVIDIA公司Scott Le Grand所發表。
• 更多利用GPU為分子動力學應用程式進行加速的相關文章
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論壇

• GPUcomputing.net上以GPU為基礎的分子模擬社群

訪談 /影片

• NVIDIA nTersect 中的2009年超級電腦大會(SC09)部落格: 透過NVIDIA CUDA技術，AMBER研究碼得到驚人的收穫

使用者可在搭載繪圖處理器的桌上型個人超級電腦或資料中心中，進行Tesla Bio Workbench應用程式配置。 這些建構於革命性大量平行CUDA架構上的解決方案是針對加速運算科學的研究結果而量身設計而成。

建議硬體配置

工作站解決方案 TESLA個人超級電腦  節省空間，可放置於桌上的個人超級電腦		資料中心解決方案 TESLA GPU運算叢集  專為大型設備運算而設計