AMBER on Tesla GPUs

AMBER on Tesla GPUs

 
 

AMBER軟體中的Generalized Born與 PMEMD 模擬功能是利用CUDA技術的繪圖處理器進行加速而完成的。透過搭配以CUDA架構所建構的Tesla GPU運算解決方案,可提供高達7倍至8倍的效能加速。

下載與安裝

測試數據

以下為利用兩台不同系統執行Generalized Born模擬的測試數據比較

NucleosomeMyoglobin
 以上數據由聖地牙哥超級運算中心提供

技術文章與簡報

論壇

訪談 /影片

GPU 解決方案

使用者可在搭載繪圖處理器的桌上型個人超級電腦或資料中心中,進行Tesla Bio Workbench應用程式配置。 這些建構於革命性大量平行CUDA架構上的解決方案是針對加速運算科學的研究結果而量身設計而成。

建議硬體配置

桌上型工作站配置資料中心配置
  • 繪圖處理器
    • 1顆Tesla C1060繪圖處理器 (CUDA版本的GROMACS目前有針對單顆繪圖處理器提供支援)
  • 中央處理器與主記憶體
    • 2.33 GHz x86 中央處理器
    • >16 GB (每一顆Tesla C1060繪圖處理器擁有4 GB的主記憶體)
  • 不適用 (CUDA版本的Amber目前尚無針對MPI提供支援)

Tesla Personal Supercomputer Tesla GPU Computing Clusters
工作站解決方案
TESLA個人超級電腦 

節省空間,可放置於桌上的個人超級電腦
 
資料中心解決方案
TESLA GPU運算叢集 

專為大型設備運算而設計